디스가이아의 이야기는 라하르가 자신의 방에 열린 관에서 일어나는 것으로 시작된다. 성의 신하 중 한 명인 에트나가 그 옆에 서 있으며, 다양한 무기들로 둘러싸여 있다. 에트나는 그가 2년 동안 잠들어 있었고, 그가 의도한 것보다 훨씬 더 오랜 시간 동안 잠들어 있었으며, 그의 아버지인 크리체프스코이 왕이 죽었다고 설명한다. 라하르는 왕좌를 되찾겠다고 다짐하고, 에트나와 다른 신하들과 상담한 후 비어스의 성으로 간다.
"다크 아도니스"라고 자칭하는 악마 비어스를 물리친 후, 라하르는 그를 "미드 보스"라고 이름 붙인다. 그 후, 그는 천사 수습생 플론느를 만난다. 플론느는 세레스티아의 지배자인 세라프 라민턴에 의해 크리체프스코이 왕(이미 죽은) 암살을 위해 저승으로 보내졌다. 아버지의 죽음에 대한 라하르의 슬픔이 없는 것에 충격을 받은 영원히 낙관적인 플론느는 악마가 사랑을 느낄 수 있는지 알아보기 위해 라하르의 파티에 합류한다. 그들을 비밀리에 관찰하는 것은 편집증에 걸린 대천사 벌카누스이며, 그는 플론느의 행동을 반역으로 해석하고 그녀가 자신을 음모하고 있다고 확신한다.
에트나가 라하르에게 자신이 고용한 프리니들의 급여를 지급하라고 요구하자, 그는 근처에서 가장 많은 돈을 가진 악마를 공격하기로 결정한다. 그 악마는 디네로 궁전의 호그마이저다. 호그마이저를 물리친 후, 라하르는 그를 죽이려 하지만 호그마이저의 아들이 뛰쳐나와 방해한다. 플론느는 라하르에게 그들을 살려주라고 설득하고, 라하르는 그들에게 일부 돈을 남겨주기로 한다. 이 행동에 대한 보답으로 호그마이저는 파티에 합류한다.
어느 순간, 플론느와 에트나는 라하르의 민망한 상황을 담은 사진을 발견한다. 라하르는 이를 "파파라치 사진"이라고 부르지만, 사진의 실제 내용은 결코 공개되지 않는다. 사진 뒷면에는 라하르가 군주직을 두고 싸우는 도전을 수락하지 않으면 이 사진의 복사본이 배포될 것이라는 위협이 적혀 있어, 라하르는 협박을 당하게 된다.
이 도전에 응답하여, 라하르는 뱀파이어 마데라스를 만난다. 그는 왕의 가장 좋아하는 간식인 검은 프레첼을 훔쳤다는 이유로 크리체프스코이 왕에 의해 추방당했다. 마데라스는 라하르의 두 가지 큰 약점인 낙관주의와 섹시한 몸매의 여성들을 이용한다. 마데라스는 또한 에트나의 기억을 조종하고 있었다. 그는 그녀에게 왕자를 죽이라고 지시했지만, 그녀는 대신 그를 독으로 두 년 동안 잠재워버렸다. 결국 에트나는 마데라스를 배신하고, 라하르, 플론느, 미드 보스와 함께 그를 물리친다.
밤 늦게 깨어난 플론느는 여러 프리니들이 성을 떠나며 chanting하고 있는 것을 발견한다. 자신의 신하들이 탈출한 것이 밝혀지면 자신의 명성이 손상될까 걱정한 라하르는 다음 날 아침 그들을 쫓아간다. 결국 그는 죽음을 만난다. 플레이어는 빅 시스 프리니가 사실 라하르의 어머니라는 것을 알게 된다; 그녀는 그를 구하기 위해 자신의 생명을 바쳤기 때문에 프리니가 되었다.
The story of Disgaea opens with Laharl rising out of an open coffin in his room. Etna, one of the castle vassals, is standing next to him, surrounded by various weapons. She explains that he has been sleeping for two years, far longer than he intended, and his father, King Krichevskoy, has died. Laharl vows to reclaim the throne, and, after consulting with Etna and his other vassals, goes to Vyers' castle.
After defeating the demon Vyers, who refers to himself as the "Dark Adonis" and is renamed "Mid-Boss" by Laharl, he meets Angel Trainee Flonne. Flonne had been sent to the Netherworld by Seraph Lamington, the ruler of Celestia, to assassinate King Krichevskoy (who was already dead). Shocked by Laharl's lack of grief at his father's death, the eternally optimistic Flonne joins Laharl's party to determine if demons are capable of feeling love. Observing them in secret is the paranoid Archangel Vulcanus, who interprets Flonne's actions as treason and is convinced that she is plotting against him.
After Etna demands that Laharl pay the salary of the Prinnies that she has hired, he decides to attack the demon with the most money in the vicinity. This is Hoggmeiser at Dinero Palace. After defeating Hoggmeiser, Laharl is about to kill him, until Hoggmeiser's son rushes out and gets in the way. Flonne convinces Laharl to spare them, and Laharl lets them keep some of the money. In response to this act, Hoggmeiser joins the party.
At one point, Flonne and Etna discover a photograph of Laharl in an embarrassing situation. Laharl refers to this as a "paparazzi shot", however, the actual contents of the photo are never actually revealed. A threat on the back of the photograph states that copies of it would be distributed if Laharl did not accept a challenge to fight for the overlordship; thus Laharl was blackmailed.
Responding to this challenge, Laharl meets Maderas, a vampire. He was banished by King Krichevskoy, for stealing the King's favorite snack, black pretzels. Maderas takes advantage of Laharl's two biggest weaknesses – optimism and women with sexy bodies. Maderas was also controlling Etna by holding her memory. He had instructed her to kill the prince, but she had put him to sleep for two years by poisoning him instead. Etna eventually betrays Maderas, and along with Laharl, Flonne, and Mid-Boss, defeats him.
Waking up later at night, Flonne discovers that several Prinnies are chanting and leaving the castle. Laharl, worried that his reputation will be tarnished if it is discovered that he let his vassals escape, chases after them the next morning. Eventually, he runs into Death, and the player learns that Big Sis Prinny is actually Laharl's mother; she became a Prinny because she gave her life to save him.
